Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6BQ99941 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6BQ99941 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF6BQ99941 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms