Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LITAFQ99732 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms