Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
MEIS3Q99687 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
MEIS3Q99687 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MEIS3Q99687 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms