Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF18Q99633 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF18Q99633 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF18Q99633 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms