Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ELF4Q99607 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELF4Q99607 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ELF4Q99607 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms