Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP4Q96P64 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP4Q96P64 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms