Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFXN2Q96NB2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN2Q96NB2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN2Q96NB2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms