Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRELID3AQ96N28 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRELID3AQ96N28 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3AQ96N28 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1047.2 ms