Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE3Q96MG7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMCE3Q96MG7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSMCE3Q96MG7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms