Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM46AQ96IP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM46AQ96IP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM46AQ96IP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM46AQ96IP4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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