Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC41A3Q96GZ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A3Q96GZ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC41A3Q96GZ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC41A3Q96GZ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC41A3Q96GZ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC41A3Q96GZ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC41A3Q96GZ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A3Q96GZ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A3Q96GZ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms