Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHBDF1Q96CC6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF1Q96CC6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF1Q96CC6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms