Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC8Q96B26 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC8Q96B26 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC8Q96B26 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 717.2 ms