Protein–RNA interactions for Protein: Q93050

ATP6V0A1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0A1Q93050 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP6V0A1Q93050 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP6V0A1Q93050 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP6V0A1Q93050 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP6V0A1Q93050 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP6V0A1Q93050 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP6V0A1Q93050 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP6V0A1Q93050 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP6V0A1Q93050 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP6V0A1Q93050 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP6V0A1Q93050 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP6V0A1Q93050 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP6V0A1Q93050 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms