Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CUL5Q93034 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUL5Q93034 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUL5Q93034 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUL5Q93034 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL5Q93034 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL5Q93034 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL5Q93034 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL5Q93034 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CUL5Q93034 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CUL5Q93034 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUL5Q93034 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CUL5Q93034 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms