Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2H4Q92759 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H4Q92759 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H4Q92759 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms