Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID1BQ8NFD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID1BQ8NFD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID1BQ8NFD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms