Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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