Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHDC9Q8NEP7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KLHDC9Q8NEP7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHDC9Q8NEP7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHDC9Q8NEP7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms