Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHST4Q8NCG5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST4Q8NCG5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST4Q8NCG5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHST4Q8NCG5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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