Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL23Q8NBE8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KLHL23Q8NBE8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL23Q8NBE8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.3 ms