Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC29Q8NA56 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC29Q8NA56 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms