Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MFSD2AQ8NA29 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MFSD2AQ8NA29 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD2AQ8NA29 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms