Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHCHD4Q8N4Q1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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