Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD4AQ8N468 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD4AQ8N468 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD4AQ8N468 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MFSD4AQ8N468 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms