Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLGN4XQ8N0W4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLGN4XQ8N0W4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN4XQ8N0W4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms