Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPAS3Q8IXF0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPAS3Q8IXF0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPAS3Q8IXF0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms