Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL3Q8IVW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL3Q8IVW4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL3Q8IVW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms