Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HERC6Q8IVU3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERC6Q8IVU3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms