Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVE0

CROCCP3, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCP3Q8IVE0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROCCP3Q8IVE0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROCCP3Q8IVE0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CROCCP3Q8IVE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROCCP3Q8IVE0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms