Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM69Q86WT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM69Q86WT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM69Q86WT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM69Q86WT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms