Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBIPQ70UQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBIPQ70UQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBIPQ70UQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBIPQ70UQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms