Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZXV5

TMTC3, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC3Q6ZXV5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMTC3Q6ZXV5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMTC3Q6ZXV5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMTC3Q6ZXV5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMTC3Q6ZXV5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMTC3Q6ZXV5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMTC3Q6ZXV5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms