Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN8

CLEC9A, C-type lectin domain family 9 member A, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC9AQ6UXN8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLEC9AQ6UXN8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC9AQ6UXN8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC9AQ6UXN8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms