Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms