Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VITQ6UXI7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VITQ6UXI7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VITQ6UXI7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms