Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L2Q6R6M4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L2Q6R6M4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L2Q6R6M4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms