Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZBED9Q6R2W3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZBED9Q6R2W3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZBED9Q6R2W3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms