Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC12Q6PEW1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC12Q6PEW1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC12Q6PEW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC12Q6PEW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC12Q6PEW1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC12Q6PEW1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC12Q6PEW1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms