Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF549Q6P9A3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF549Q6P9A3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF549Q6P9A3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF549Q6P9A3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms