Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MCTP1Q6DN14 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCTP1Q6DN14 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCTP1Q6DN14 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCTP1Q6DN14 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms