Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC9A4Q6AI14 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9A4Q6AI14 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A4Q6AI14 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A4Q6AI14 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms