Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ECM29Q5VYK3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ECM29Q5VYK3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ECM29Q5VYK3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ECM29Q5VYK3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms