Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TREML2Q5T2D2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TREML2Q5T2D2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TREML2Q5T2D2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TREML2Q5T2D2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TREML2Q5T2D2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TREML2Q5T2D2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TREML2Q5T2D2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms