Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRT3Q5FWE3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRRT3Q5FWE3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRRT3Q5FWE3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms