Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NOM1Q5C9Z4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NOM1Q5C9Z4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NOM1Q5C9Z4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NOM1Q5C9Z4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms