Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCAF6Q58WW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCAF6Q58WW2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DCAF6Q58WW2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms