Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CDCA8Q53HL2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CDCA8Q53HL2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CDCA8Q53HL2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDCA8Q53HL2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDCA8Q53HL2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDCA8Q53HL2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CDCA8Q53HL2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDCA8Q53HL2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDCA8Q53HL2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDCA8Q53HL2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDCA8Q53HL2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CDCA8Q53HL2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDCA8Q53HL2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CDCA8Q53HL2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDCA8Q53HL2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDCA8Q53HL2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms