Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIPR1Q53HC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIPR1Q53HC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIPR1Q53HC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIPR1Q53HC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms