Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL12Q53G59 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL12Q53G59 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL12Q53G59 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL12Q53G59 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms