Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SBK1Q52WX2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SBK1Q52WX2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SBK1Q52WX2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SBK1Q52WX2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SBK1Q52WX2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms